kotlinのスケルトンプロジェクトを作るのは、一旦Javaのプロジェクトを作ってからKotlinのコードにコンバートするのが楽なようです。
Android Studioを起動して、[Start a new Android Studio project]を選択します。

アプリケーション名は適当に「Kotlintest」にしました。[Next]ボタンを押下します。

サポートする最低SDK等はそのままです。[Next]ボタンを押下します。

[Blank Activity]を選択しました。[Next]ボタンを押下します。

Activityの名前等もそのままです。[Finish]ボタンを押下します。

これでJavaでのスケルトンアプリのプロジェクトが完成しました。
このプロジェクトをKotlinにコンバートしてみましょう。プロジェクトペインからMainActivityを選択した状態でツールバーから[Convert Java File to Kotlin File]を選択します。

本当に変更して良いのか確認のダイアログが表示されます。[OK]ボタンを押下します。これでソースコードが書き換わりました。

この状態のままだと実行できないので上の方にKotlin not configuredを表示されます。Configureボタンを押下して、[Android with Gradle]を選択します。
ここは何を選ぶのが正解なのか分からなかったのですが、デフォルトで選択されていた[All modules containing Kotlin files: app]を選択して、[OK]ボタンを押下します。

あとは実行します。
おわり
